宏基因转录代谢组
简介
宏基因-转录-代谢组联合分析
简介:
宏基因-转录-代谢组联合分析主要用于从微生物群落的基因组成、基因表达和代谢产物三个层面系统解析微生物群落的结构与功能变化。宏基因组可分析样本中微生物的物种组成、功能基因、代谢通路和耐药基因等;宏转录组可进一步反映微生物群落中哪些基因处于活跃表达状态;代谢组则可检测短链脂肪酸、胆汁酸、氨基酸、有机酸、脂类等代谢物变化。三者联合分析能够从“有哪些菌”“具有什么功能”“哪些功能被激活”“产生了哪些代谢产物”等角度综合解释微生物群落与宿主表型、疾病进展或干预效果之间的关系。该项目常用于肠道菌群研究、炎症性肠病、代谢疾病、抗衰老、营养干预、药物作用机制、益生菌功能评价、感染模型和环境微生物功能研究。